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第一篇!生物分子的结构与功能 !!氨基酸的 "干式恒温仪#取决于它的 !羧基、!氨基和 $基团的可解离基团的解离常数(见表 %&)。其计算 公式为 "# ’& ( (!羧基) ) (!]其 "#为兼性 %["!&"!% 氨基)。对于侧链中含有可解离基团的氨基酸, 离子两边 "!(解离常数的负对数)的平均值。 表 ! "#氨基酸的解离常数与等电点 (!羧基) (!氨基) ($基团) 氨!基!酸 "!&"!%"!$"# 甘氨酸(*+,-./0,1+,,1) %234 5267 8259 丙氨酸(:+:/./0,;+:,;) %234 5265 627% 缬氨酸(<:+./0,=:+,=) %23% 526% 8259 亮氨酸
(+0>-./0,?0>,?) %236 5267 825@ 异亮氨酸(.AB+0>-./0,#+0,#) %236 526@ 627% 苯丙氨酸("C0/,+:+:/./0,DC0,E) &2@3 52&3 824@ 脯氨酸("FB+./0,DFB,D) &255 &7256 624@ 半胱氨酸(-,AG0./0,H,A,H) &256 @2&@ &72%@ 8279 丝氨酸(A0F./0,I0F,I) %2%& 52&8 &3267 826@ 色氨酸(GF,"GB"C:/,JF",K) %23@ 5235 82@5 酪氨酸(G,FBA./0,J,F,L) %2%7 52&& &7279 8266 蛋氨酸(M0GC.B/./0,M0G,M) %2%@ 52%& 8298 苏氨酸(GCF0B/./0,JCF,J) %2&& 526% &3267 82@9 谷氨酰胺(*+>G:N./0,1+/,O) %2&9 52&3 8268 天冬酰胺(:A":F:*./0A,;A/,P) %27% @2@7 824& 谷氨酸(*+>G:N.-:-.Q,1+>,R) %2&5 5269 42%8 32%% 天冬氨酸(:A":FG.-:-.Q,;A",S) &2@@ 5267 3268 %299 赖氨酸(+,A./0,?,A,T) %2&@ @258 &7283 5294 精氨酸
(:F*././0,;F*,$) %2&9 5274 &%24@ &7296 组氨酸(C.AG.Q./0,U.A,U) &2@% 52&9 6277 9285 ! !%2氨基酸的紫外吸收和呈色反应 !!酪氨酸和色氨酸分子中含有共轭双键,在紫外光%@7 /N 波长处有最大吸收峰(图 %3)。此特性可用于蛋白质的定 量分析。茚三酮(/./C,QF./)水合物遇热被还原,可与氨基酸 在加热时释放的氨结合,生成蓝紫色化合物。此化合物在 897 /N波长处有最大吸收峰,其峰值与氨的生成量成正比, 也可用于氨基酸的定量分析。 二、氨基酸在蛋白质分子中的连接方式 !!蛋白质分子中氨基酸之间以肽键( "0"G.Q0 VB/Q)相连 接,肽键是一个氨基酸的 !羧基和另一氨基酸的 !氨基 W & && 脱水连接形成的酰胺键( H% %% % %% P $ $$ % %% )。 图 % 3!芳香族氨基酸的紫外吸收光谱 U$& $% $& $% H $ $$ U% P% %% % %% HWWU ) HU% P% %% $ $$ % %% HWWU U%% %%% ! W HU% P% %% $ $$ % %% % %% % %% HW PU H $ $$ % %% HWWU 氨基酸以肽键相连接形成的化合物称为肽("0"G.Q0)。肽中的氨基酸单位称为氨基酸残基( :N./B :-.Q F0AX 第二章 3蛋3白3质"! !"#$)。由 %个氨基酸残基组成的肽称为二肽( "!&$&’!"$);由 (个氨基酸残基组成的肽称为三肽( ’)!&$&* ’!"$),以此类推。不足 +,个氨基酸残基组成的肽称为多肽(&-./&$&’!"$),0,个以下氨基酸残基组成的肽 又常被称为寡肽(-.!1-&$&’!"$)。大多数蛋白质的氨基酸残基数在 +, 2 %,,,之间。 33一条多肽链常含有 %个游离的末端,一端是未参与形成肽键的 !氨基,称为氨基(末)端或 4(末) 端;另一端是未参与形成肽键的 !羧基,称为羧基(末)端或 5(末)端。多肽链的序号从 4端计算。书写 肽链时,人们习惯上将 4端写于左侧,用 6%4—或 6—表示; 5端写于右侧,用— 5776或— 76表示,有时 不对末端加以标记,只凭序号或从左到右的排列来指
示多肽链的走行方向。 33多肽的命名原则是,除 5端的氨基酸残基外,所有氨基酸残基均按酰基命名,并从 4端依次列出,最 后加上 5端氨基酸残基的名称。例如,五肽 8—9—9—:—;的名称是酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙氨酰蛋 氨酸。多肽链中以肽键连接形成的长链称为主链,氨基酸残基的 <基团称为侧链。 3 3%,种氨基酸在各种蛋白质中出现的概率不尽相同,其平均相对分子质量为 00,,可用此数据来估算蛋 白质的相对分子质量或蛋白质中氨基酸残基的数目。 三、生物活性肽 33人体内有一些生理活性物质是由几个至几十个氨基酸残基组成的肽,统称为生物活性肽。 "谷胱甘 肽(" 1.#’=’>!-?$)是由 (个氨基酸残基组成的三肽,特殊之处是谷氨酸以其 "羧基与半胱氨酸的 !氨